于1937年10月29日正式编成的华中方面军由松井任司令官，下辖上海派遣军和第10军。上海派遣军司令官是朝香鸠彦，第10军司令官为柳川平助。除第101师团守上海外，华中方面军的部队几乎全部参加了进攻南京的战斗。11月25日，日军占领无锡后，即策定兵为三路进犯南京。12月1日下达攻击南京的命令。

　　12月5日，朝香鸠彦到达前线，听取了第16师团长中岛的汇报。中岛对他的上司讲： "日军已攻破了南京周围所有的环形防线，约30万左右的中国军队大概就要全部被包围，逃不出南京城了。"朝香鸠彦听后，回到司令部。发出了一连串由他个人盖章签署的命令，上面有“机密，阅后销毁”的字样。命令十分简单：“杀掉全部俘虏”。"杀掉全部俘虏"正是日本当局用恐怖手段迫使中国屈服的具体体现。

　　从现在发现的历史资料看，杀掉全部俘虏的命令是执行得十分彻底的。师团一级部队中，有第16师团师团长中岛的日记；旅团一级部队中，有第13师团第103旅团旅团长山田的作战日志；联队以下部队中，有当时的战斗详报。这些历史资料均无可置疑地证明：军以上司令部确有杀掉全部俘虏的命令，而且各部队都传达贯彻了，将俘虏一批又一批地集体杀掉了。

中岛日记

　　南京城12月13日失陷。日军进城后，即按着松井的作战纲要，开始扫荡。下边是中岛12月13日的日记摘抄。

"扫荡俘虏 ……

　　"近几日，溃败的敌人，大部分逃进我第16师团作战地域内的森林和村庄，其中有从镇江西要塞逃过来的人。俘虏到处可见，达到难以收拾的程度。

　　 "因采取大体不留俘虏之方针，故决定全部处理之。然对1千、5千、1万之众，解除全部武器都很困难。唯一办法，是等他们完全丧失斗志，自己排队来降，较为稳妥，这帮人一旦闹事，将难以收拾。 "故而用卡车增派部队，对其进行监视和引导。……

　　"据知：光是佐佐木部队就处理掉约15000人，守备太平门的一中队长处理掉1300人。现集中在仙鹤门附近的约有7000-8000人，而且俘虏还在不断来降。

　　"处理掉这7000-8000人。需要一个相当大的壕沟，很不容易找到。所以预定把他们先分成100人、200人一群，然后诱至适当地点处理之。"

　　师团一级指挥官都说是上级的方针，并带头执行，为"处理"俘虏而绞尽脑汁，这就有力地证明南京大屠杀是一次有计划有组织的政治犯罪。

　　日军就是以捕杀俘虏为名，挨家挨户捕杀居民。闯进国际难民区对鱼民进行"甄别"、"审查"，诬难民是俘虏，成批成批地抓捕，然后 将我同胞集体杀掉。中岛日记中也露出日军不仅屠杀俘虏，而且屠杀普通居民的蛛丝蚂迹。由于"进城扫荡时连技师和工人都处理掉，造成无人开动机器"，而使南京长期断电断水。

山田日志

　　这一份材料来自田中正明自己的《虚构》一书。田中先生本意要证明"杀掉全部俘虏纯属无稽之谈"，却无意中泄露“天机。该书叙述第13师团第103旅团在幕府山俘获14000名俘虏，山田旃二旅团长"对处理俘虏深感头痛"。下面是书中的原文：

       这一天，军司令部派宪兵军官检查俘虏是怎样处置的，山田少将陪着看了成群的俘虏。山田少将问：“喂，杀掉他们吗？”因为他在此之前刚接到参谋长关于“杀掉俘虏”的命令。……

　　上述的上万名中国俘虏，就在军参谋长这一道命令下，全部被"处理掉"了，造成了南京大屠杀中最大的"草鞋峡惨案"。